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Une voie, plusieurs choix
Informatique et Mathématiques appliquées
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> Formation > Cursus ingénieur

Bioinformatique - 5MMBIOI3

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  • Volumes horaires

    • CM : 36.0
    Crédits ECTS : 3.0

Objectifs

Les objectifs de ce module sont de fournir:

  • une culture générale en biologie post-génomique, particulierement en bioinformatique et en biologie systémique qui en sont deux composantes essentielles;
  • une connaissance du langage Perl, qui sera enseigné par la pratique à travers une application en bioinformatique;
  • une introduction à la modélisation en biologie, basée en particulier sur les systèmes dynamiques.
Contact Nicolas THIERRY-MIEG

Contenu

Cette UE se découpe en deux parties complémentaires.
La première partie aborde en particulier:

  • Rappels de biologie à l'ère [post-]génomique.
  • Présentation et utilisation de sources de données biologiques: protéines (Uniprot), interactions entre biomolecules (Intact etc...), annotation fonctionnelle (Gene Ontology).
  • Apprentissage de Perl pour la bioinformatique.
  • Utilisation d'un SGBDOO "orienté biologie" (acedb).
    La seconde porte sur:
  • Rappels sur les sytèmes dynamiques.
  • Présentation de formalismes discrets pour la modélisation de réseaux biologiques.
  • Application au cycle cellulaire.


Prérequis

Aucun.

Contrôles des connaissances

CONTRÔLE CONTINU :
Type d'évaluation (ex : TP, assiduité, participation) :

SESSION NORMALE :
Type d'examen (écrit, oral, examen sur machine) : Projet + Synthèse d'article
Salle spécifique :
Durée :
Documents autorisés (ex : aucun, résumé feuille A4 manuscrite, dictionnaires, tous documents) :
Documents interdits (ex : livres, tous documents) :
Matériel (ex : calculatrices):

  • matériel autorisé, préciser :
  • matériel interdit, préciser :
    Commentaires :

SESSION DE RATTRAPAGE :
Type d'examen (écrit, oral, examen sur machine) :Oral session 2
Salle spécifique :
Durée :
Documents autorisés (ex : aucun, résumé feuille A4 manuscrite, dictionnaires, tous documents) :
Documents interdits (ex : livres, tous documents) :
Matériel (ex : calculatrices):

  • matériel autorisé, préciser :
  • matériel interdit, préciser :
    Commentaires :


N1 = (Projet + Synthèse d'article) / 2
N2 = Oral

Informations complémentaires

Cursus ingénieur->Filière MMIS->Semestre 9

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mise à jour le 15 janvier 2017

Grenoble INP Institut d'ingénierie Univ. Grenoble Alpes