Ensimag Rubrique Formation 2022

Bioinformatique - 5MMBIOI3

  • Volumes horaires

    • CM 36.0

    Crédits ECTS

    Crédits ECTS 3.0

Objectif(s)

Les objectifs de ce module sont de fournir:

  • une culture générale en biologie post-génomique, particulierement en bioinformatique et en biologie systémique qui en sont deux composantes essentielles;
  • une connaissance du langage Perl, qui sera enseigné par la pratique à travers une application en bioinformatique;
  • une introduction à la modélisation en biologie, basée en particulier sur les systèmes dynamiques.
Contact Nicolas THIERRY-MIEG

Contenu(s)

Cette UE se découpe en deux parties complémentaires.
La première partie aborde en particulier:

  • Rappels de biologie à l'ère [post-]génomique.
  • Présentation et utilisation de sources de données biologiques: protéines (Uniprot), interactions entre biomolecules (Intact etc...), annotation fonctionnelle (Gene Ontology).
  • Apprentissage de Perl pour la bioinformatique.
  • Utilisation d'un SGBDOO "orienté biologie" (acedb).
    La seconde porte sur:
  • Rappels sur les sytèmes dynamiques.
  • Présentation de formalismes discrets pour la modélisation de réseaux biologiques.
  • Application au cycle cellulaire.


Prérequis

Aucun.

Contrôle des connaissances

CONTRÔLE CONTINU :
Type d'évaluation (ex : TP, assiduité, participation) :

SESSION NORMALE :
Type d'examen (écrit, oral, examen sur machine) : Projet + Synthèse d'article
Salle spécifique :
Durée :
Documents autorisés (ex : aucun, résumé feuille A4 manuscrite, dictionnaires, tous documents) :
Documents interdits (ex : livres, tous documents) :
Matériel (ex : calculatrices):

  • matériel autorisé, préciser :
  • matériel interdit, préciser :
    Commentaires :

SESSION DE RATTRAPAGE :
Type d'examen (écrit, oral, examen sur machine) :Oral session 2
Salle spécifique :
Durée :
Documents autorisés (ex : aucun, résumé feuille A4 manuscrite, dictionnaires, tous documents) :
Documents interdits (ex : livres, tous documents) :
Matériel (ex : calculatrices):

  • matériel autorisé, préciser :
  • matériel interdit, préciser :
    Commentaires :


N1 = (Projet + Synthèse d'article) / 2
N2 = Oral

Informations complémentaires

Cursus ingénieur->Filière MMIS->Semestre 9