Bioinformatique
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Objectifs
Les objectifs de ce module sont de fournir:
- une culture générale en biologie post-génomique, particulierement en bioinformatique qui en est une composante essentielle;
- une connaissance du langage Perl, qui sera enseigné par la pratique à travers des applications en bioinformatique.
Contact Nicolas THIERRY-MIEG
Contenu - Rappels de biologie à l'ère [post-]génomique.
- Introduction à la bioinformatique, morceaux choisis.
- Présentation et utilisation de sources de données biologiques: protéines (Uniprot), interactions entre biomolecules (Intact etc...), annotation fonctionnelle (Gene Ontology),...
- Apprentissage de Perl pour la bioinformatique.
- Utilisation d'un SGBDOO "orienté biologie" (acedb).
- Analyse de réseaux biologiques.
PrérequisAucun.
Contrôles des connaissances session 1: projet.
session 2: oral.
N1 = P
N2 = O
Informations complémentaires
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