Biologie computationnelle (en anglais) - 5MM2533I

Volumes horaires
- CM 18.0
- Projet -
- TD -
- Stage -
- TP -
- DS -
Crédits ECTS
Crédits ECTS 1.5

Objectif(s)

Ce cours interdisciplinaire est conçu pour les candidats ayant une formation informatique ou mathématique ou une formation biomédicale. Il fournit aux étudiants les compétences nécessaires pour s'orienter vers la bioinformatique et la biologie computationnelle. L'objectif est de fournir une brève introduction à la modélisation bioinformatique et des outils avancés pour l'analyse des données de séquence. La langue du cours est l'anglais.

Responsable(s)

Olivier FRANCOIS

Contenu(s)

La première partie du cours se concentre sur les applications en biologie moléculaire et en évolution, la classification hiérarchique et l'analyse des données phylogénétiques. La deuxième partie du cours se concentre sur l'apprentissage automatique pour les données biologiques. Elle comprend la détection des points de changement dans les séquences et la classification non supervisée de données génétiques massives. Le cours est évalué avec deux projets, un pour chaque partie du cours.

Prérequis

Compétence de base en mathématiques appliquées, programmation (python, R, ou matlab) et statistique. Aucun prérequis spécifique.

Contrôle des connaissances

CONTRÔLE CONTINU :
Type d'évaluation (ex : TP, assiduité, participation) : Projets notés

SESSION NORMALE :
Type d'examen (écrit, oral, examen sur machine) : écrit et oral
Salle spécifique :
Durée :
Documents autorisés (ex : aucun, résumé feuille A4 manuscrite, dictionnaires, tous documents) :
Documents interdits (ex : livres, tous documents) :
Matériel (ex : calculatrices):

matériel autorisé, préciser :
matériel interdit, préciser :
Commentaires :

SESSION DE RATTRAPAGE :
Type d'examen (écrit, oral, examen sur machine) :
Salle spécifique :
Durée :
Documents autorisés (ex : aucun, résumé feuille A4 manuscrite, dictionnaires, tous documents) :
Documents interdits (ex : livres, tous documents) :
Matériel (ex : calculatrices):

matériel autorisé, préciser :
matériel interdit, préciser :
Commentaires :

N1 = 0.5*E1a + 0.5*E1b
N2 = E2

L'examen existe uniquement en anglais